Trung tâm đã có quan hệ hợp tác nghiên cứu khoa học và được tài trợ của: Quỹ Nhi đồng Liên hợp quốc (UNICEF), Tổ chức Y tế Thế giới (WHO), Quỹ dân số liên Hiệp Quốc (UNFPA), UNILEVER Việt Nam, Quỹ phát triển quốc tế Vương quốc Anh (DFID), Tổ chức phòng chống mắt hột quốc tế (ITI), JICA Việt Nam, Ngân hàng thế giới (WB), Ngân hàng châu Á (ADB), Uỷ ban Châu Âu (EU), Chính phủ Hà Lan, Monkey Forest Consulting Limited (MFC), East Meets West, Chemonics International Inc., Quỹ Ung thư cổ tử cung Úc (ACCF), USAID. CEHS đã tạo ra mối liên hệ chặt chẽ với các Vụ/Cục thuộc Bộ Y tế, các Đại học Y dược, các Sở Y tế các tỉnh/thành phố, Trung tâm Truyền thông Giáo dục Sức khỏe tỉnh, TTYT huyện và TYT xã của hầu hết các tỉnh/thành phố tại Việt Nam.